Jednou z klíčových charakteristik motorů 125 Junior MAX a 125 MAX je nová řídící jednotka (ECU). Používá se také pro motory Rotax 125 Micro a Mini MAX. ECU je uložena v gumové vložce, aby se minimalizovaly vibrace na řídící jednotce, konektoru a kabelech. Mírně pozměněné časování zapalování umožňuje použití větší hlavní trysky karburátoru. Výsledkem je dobrá odezva na plyn při nízkých otáčkách přičemž je stále zachován široký rozsah otáček až po omezovač nastavený na 14 800 otáček za minutu.
